Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grin1P35438 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms