Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfap2aP34056 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tfap2aP34056 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms