Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pola1P33609 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms