Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc11P31313 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms