Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccnd2P30280 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccnd2P30280 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms