Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtgfP29268 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CtgfP29268 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms