Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrgP28705 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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