Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BgnP28653 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BgnP28653 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BgnP28653 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BgnP28653 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BgnP28653 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms