Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hoxd10P28359 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Hoxd10P28359 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Hoxd10P28359 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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