Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa3P28310 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms