Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa2P28309 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms