Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
H2-DMaP28078 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms