Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NdnP25233 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NdnP25233 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NdnP25233 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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