Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk11bP24788 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk11bP24788 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms