Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tsta3P23591 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms