Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms