Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cbx3P23198 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms