Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Klra1P20937 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klra1P20937 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms