Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms