Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TP20293 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TP20293 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TP20293 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TP20293 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TP20293 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TP20293 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms