Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NefhP19246 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NefhP19246 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NefhP19246 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NefhP19246 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NefhP19246 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NefhP19246 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NefhP19246 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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