Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifrd1P19182 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd1P19182 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms