Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RargP18911 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RargP18911 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RargP18911 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RargP18911 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RargP18911 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RargP18911 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RargP18911 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RargP18911 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms