Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtpraP18052 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpraP18052 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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