Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spi1P17433 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms