Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Myf6P15375 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Myf6P15375 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms