Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms