Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rplp0P14869 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rplp0P14869 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms