Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms