Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Krt8P11679 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt8P11679 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms