Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fv4P11370 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fv4P11370 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms