Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxd4P10628 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd4P10628 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms