Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxb4P10284 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb4P10284 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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