Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Schip1P0DPB4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Schip1P0DPB4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms