Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnmt3cP0DOY1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms