Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Amd1P0DMN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Amd1P0DMN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms