Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc8P09025 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc8P09025 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms