Protein–RNA interactions for Protein: P08884

Gzme, Granzyme E, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmeP08884 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GzmeP08884 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GzmeP08884 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms