Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApoeP08226 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ApoeP08226 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms