Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col4a2P08122 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col4a2P08122 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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