Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TtrP07309 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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TtrP07309 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TtrP07309 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TtrP07309 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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