Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csf1P07141 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms