Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gh1P06880 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gh1P06880 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gh1P06880 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms