Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa4P06798 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms