Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GzmbP04187 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GzmbP04187 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms