Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-K1P01901 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-K1P01901 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms