Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01800 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01800 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01800 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01800 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01800 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01800 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01800 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01800 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01800 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01800 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01800 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01800 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01800 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms