Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccl20O89093 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl20O89093 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccl20O89093 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccl20O89093 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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