Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hcn2O88703 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn2O88703 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms