Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srpk1O70551 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms